前國民黨立委邱毅指出，民進黨總統候選人蔡英文在1999年8月16日，寫了一封信給當時的國安局長丁渝洲，希望丁給蔡262萬元說要進行研究「特殊國與國關係」，隔天這筆錢就下來了，這專案叫做「816專案」。對此，民進黨立委陳其邁說，邱毅舊案重爆，且這個案子已經經過特偵組偵結，根本沒有問題。

蘋果即時報導，近日緊咬民進黨總統候選人蔡英文炒地事件的國民黨立委蔡正元、前立委邱毅上午再爆料，直指蔡英文在任職教授期間，在1999年8月16日為了要研究特殊國與國關係，寫信給時任國安局長的丁渝洲，稱需要262萬；隨後邱毅秀出一張領據說，丁渝洲在隔日就撥款，這專案叫做「816專案」。

邱毅痛批，「蔡英文都要把兩國論推給李登輝，但這研究計劃以想了很清楚，要研究特殊國與國關係，這不是兩國論那是什麼？」

邱毅說，蔡英文何必掩耳盜鈴呢？蔡英文這個做法，有沒有違反國安局組織法？政府採購法？「一封信隔天就可以要到錢，有沒有違法？」

邱毅質疑，蔡英文與前總統李登輝當時是什麼關係？關係密切到這種程度，一封信國安局長就馬上點頭撥款，兩張研究計劃書就要到262萬元？邱毅說，「蔡英文說謊，兩國論不就是蔡英文與李登輝的傑作嗎？」蔡英文大錢也要小錢也要，當時還領18％，怪不得跟陳水扁的貪腐集團那麼好，怪不得陳水扁的貪腐集團要藉著蔡英文來借屍還魂、班師回朝。

蔡正元則說，「這撥款的速度空前未有之快速，去問問行政單位，哪有一個人提一格計劃書，第二天就馬上撥款，且一頁高達131萬！」所以兩國論根本就是李登輝與蔡英文共同合作的結果，蔡英文不要再去正式場合把兩國論推給李登輝，並稱李登輝是國民黨的總統，因為國民黨那麼多任總統，只有一個是蔡英文的乾爸爸。

邱毅補充，這份公文出現的時候，當時國安三法通過了，國安局有了組織法，所以有一定的撥款程序，也必須符合政府採購法正常合法的程序，試問，有哪一個請款案，提出的研究的計劃，全台灣哪一個教授，提了一個計劃給法制化公務機關，可以一封信就讓錢在隔天如數撥下來，這是一個非常明顯違法的公文。

邱毅要求蔡英文必須回應此事，當時是何種強大的壓力之下，國安局寧可違反組織法與採購法，把錢迅速撥下，而這錢說要研究特殊國與國關係，到底中間的內容是什麼，「這是個黑箱，要蔡英文告訴大家」，這兩國論、特殊國與國關係的內容是什麼？

針對邱毅爆料，民進黨立委陳其邁說，邱毅早在2011年5月就爆過相同的料，就是舊案重爆且這個案子已經經過特偵組偵結，根本沒有問題，現在又拿來重提，懷疑邱毅的記憶可能有很多狀況，建議邱毅去做電腦斷層和腦波檢查，「為什麼會忘得一乾二淨？」陳還說，他站在醫師人道立場，希望邱能盡快去檢查，「對他比較好！」

民進黨發言人阮昭雄今表示，國民黨今日抹黑記者會針對「816專案」的質疑，信用破產的邱毅先生在4年前就已經講過的舊資料，且本案在邱毅先生於2011年5月告發後，便已經司法機關查明並偵結，國民黨舊案重炒，根本就是惡質抹黑。