針對近期共諜案頻傳，涉及機敏機關人員甚至包括前外交部長幕僚等案例，引發社會高度關注，行政院長卓榮泰17日於行政院會中明確裁示，為防堵境外敵對勢力滲透政府機關，要求政務委員馬永成於兩週內研擬強化國安制度方案，並檢視現行公務員忠誠查核機制是否落實或需調整精進。

卓榮泰表示，近來數起共諜案揭示我國機敏機關在防範滲透上的潛在漏洞，面對日益嚴峻的國安挑戰，政府必須展現制度改革決心。他強調，依據《公務人員任用法》第4條，凡涉及國家安全或重大利益之職務人員，應進行特殊查核，目前制度雖有設計，但仍需全面檢視執行落實狀況，並因應國際與兩岸情勢變化，針對查核範疇、頻率與對象進行強化。

現行制度以職等與職稱作為忠誠查核依據，未來行政院將研議是否改以「接觸機密程度」作為新準則，並考慮推動入職後定期或不定期查核機制。卓榮泰指出，絕大多數公務員都奉公守法、為民服務，但面對國安風險，政府有責任強化制度，也藉此保障守法人員，建立更嚴謹的行政體系。他呼籲全體公務員必須強化國安意識，堅守對國家的忠誠與承諾。

行政院發言人李慧芝轉述表示，政府並非為「考核而考核」，相關查核制度已有具體辦法與救濟程序，未來檢討方向並非推翻現行制度，而是落實既有規範，並針對執行面提出精進對策。她也說，外交部共諜案涉案人員入職時確實有經過忠誠查核，但顯示目前機制仍有不足，因此未來是否轉向「每年定期查核」也在研議之列。

針對外界關切公務員是否被要求填寫未在中國設籍的具結書，陸委會法政處副處長董玉芸表示，相關清查作業尚在進行中，具體查核結果尚未出爐。另媒體追問是否需修改《公務人員任用法》，政委林明昕回應，目前忠誠查核已有法源基礎，包括法律授權訂定的命令與辦法，針對涉及國安的職務已具體列明執行標準與適用對象，並強調相關措施皆設有救濟管道，不會任意侵害個人權益。

林明昕強調，未來若要推動任用後之持續查核，可能超出現行《任用法》所規範，是否修法將需跨院會同討論，但目前首要之務是落實執行、確認制度設計能符合現實防滲需求。