民眾黨主席柯文哲因京華城案及政治獻金案被起訴，相關案件引發對眾望基金會運作模式的討論。民眾黨秘書長周榆修指稱眾望基金會與民進黨新境界文教基金會性質相同，遭民進黨秘書長林右昌嚴正駁斥，強調兩者性質完全不同，並指民眾黨刻意誤導視聽。

周榆修表示，眾望基金會從事慈善工作，並為柯文哲制定長照保險政策，運作模式與新境界文教基金會無異。他更提到，木可公司商品的經營方式類似於民進黨過去在大選期間推出的「扁帽工廠」、「小英商號」和「賴桑小舖」。

林右昌則指出，新境界文教基金會是由民進黨中常會正式議決通過，捐助成立的政策研究機構，是民進黨組織的一部分，其董事長由黨主席兼任，屬於附隨智庫組織。而眾望基金會則是一個一般財團法人，成立目的在於台北市的照顧與社會關懷，與政黨或選舉無關。檢調卻查出，眾望基金會資金被挪用支付民眾黨相關黨工與競選總部員工薪水，這與新境界文教基金會的運作性質有根本差異。

林右昌強調，民眾黨將兩者相提並論，是抹黑並誤導視聽。他批評周榆修的言論動機不純，並指出其手法非常不可取。至於柯文哲的辯解內容，林右昌則表示不予置評。

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