明年度中央政府總預算案陷入僵局，核心原因之一在於原住民禁伐補償金額問題。行政院堅持補償金額為每公頃4萬元，低於立法院通過的6萬元補償版本，導致在野黨不滿，預算案無法順利推動。針對此問題，立委徐巧芯在立法院對行政院長卓榮泰展開質詢，要求釐清行政院不提覆議的理由以及其財政考量。

根據現行法案，原住民禁伐補償金額應為每公頃6萬元，該方案由民進黨立委陳瑩提出並獲得多數黨內立委支持。然而，最終行政院僅願意編列4萬元的補償，這一決定讓包括國民黨在內的在野黨立委質疑政府內部的協調與決策過程。徐巧芯特別指出，民進黨內部立委廣泛支持6萬元方案，為何作為執政機構的行政院卻僅同意較低的金額，這樣的矛盾決策引發了國會內部的混亂。

徐巧芯強烈質疑行政院當初為何不就此提覆議。她表示，當立法院通過的法律被認為與現行財政政策不符時，根據憲法，行政院應該提覆議，但行政院卻選擇不提，這讓人無法理解。卓榮泰則解釋，當時不提覆議是因為即便提出，行政院也將面臨來自立法院強烈的批評，並表示不提覆議是為了尋求更柔性解決方案。

此外，徐巧芯還指出，國民黨曾基於跨黨派合作的精神支持無黨籍立委高金素梅提出的5萬元補償版本，這一方案更接近行政院的立場，且能在補償金額上尋求妥協。然而，當民進黨內部立委提出更高的6萬元方案時，國民黨也選擇支持該版本，希望能更好地保障原住民的權益。她質疑，既然黨內立委如此大力推動6萬元方案，為何行政院卻選擇較低的金額，讓整個議程卡關。

對於這一質疑，卓榮泰強調，行政院的最終決策是基於財政考量。政府必須平衡原住民權益和國家財政負擔，並在兩者之間取得最佳平衡。他解釋，4萬元的補償金額是在多方考量後得出的較為可行的方案，且政府在過程中進行了多次溝通，包括與民進黨內部的協調。但他同時也承認，這一決策無法完全滿足所有立委的期望。

卓榮泰進一步指出，行政院必須考量政策的實際執行能力以及財政的可持續性，因此最終未能採納6萬元補償方案。他還強調，這是一個超越黨派利益的討論，政府始終將國家整體財政狀況放在優先考量的位置。

徐巧芯則回應，政府應該在早期溝通中更加清晰地表達其財政立場，避免在立法院內部引發混亂。她強調，未來政府在與立法機構溝通時應該加強協調，以免類似的情況再次發生，並希望行政院能在重大政策上更早明確立場，避免造成不必要的預算卡關局面。