綜合報導，藻礁公投連署在2日突破35萬安全門檻，行政院發言人羅秉成4日強調，此案不是人民在對抗政府，也不是環保在對抗經濟，更精確地說，是環保與環保之間抉擇的問題。他說，此議題是對單一政策公投，非政治公投，盼勿有過多政治語言。

羅秉成說，行政院立場是全力保護藻礁，這樣的立場、理念，與民間團體、年輕人是站在一起、是一樣的，「我們不是互相為對手，我們可以攜手、可以握手，共同解決這個問題」。

他另外也表示，三接政策計畫若中止，要選其他地方，至少推遲超過10年以上，電力恐因此吃緊，但北部供電非常重要，包括竹科都是重中之重、要保護的產業。

至於三接（第三天然氣接收站案）環評爭議，羅秉成說，環保署已對外多次說明，環團也曾向行政法院提訴訟，但高等行政法院已駁回，這說明了相關程序是在依法行政下進行，他能理解環團仍然有不同意見，但相關政策、法律程序都可以理性對話、充分溝通。

針對三接興建及藻礁保育議題，總統府發言人張惇涵表示，連署跟公投都是人民的權利，也是台灣民主多元的展現，「我們都充分尊重」，即使連署成案之後，執政團隊也會加強、誠懇的跟社會各界溝通。